Το Πανεπιστήμιο Αιγαίου έλαβε την υψηλότερη βαθμολογία μεταξύ όλων των Πανεπιστημίων της χώρας με βάση τις εκθέσεις Εξωτερικής Αξιολόγησης της Αρχής Διασφάλισης και Πιστοποίησης της Ποιότητας στην ανώτατη εκπαίδευση
Το Πανεπιστήμιο Αιγαίου έλαβε ως συνολική ιδρυματική αξιολογική επίδοση την υψηλότερη προβλεπόμενη, «Worthy of Merit (Άξια Θετικής Μνείας)», ένα από επτά συνολικά Πανεπιστήμια με την υψηλότερη αυτή επίδοση (Πανεπιστήμιο Αιγαίου, Πανεπιστήμιο Κρήτης, Ανωτάτη Σχολή Καλών Τεχνών, Διεθνές Πανεπιστήμιο, Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης, Πολυτεχνείο Κρήτης, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών).
Επιπλέον, το Πανεπιστήμιο Αιγαίου έλαβε τις συνολικά υψηλότερες βαθμολογίες στις 26 επιμέρους ενότητες, μεταξύ όλων των Πανεπιστημίων της χώρας: 18 Worthy of Merit (Άξια Θετικής Μνείας), 7 Positive (Θετική), 1 Partially Positive (Εν Μέρει Θετική).
Σύμφωνα με τις Εκθέσεις Εξωτερικής Αξιολόγησης των 22 Πανεπιστημίων της χώρας Προσφάτως που διεξήχθησαν στο τέλος του 2015 και τις αρχές του 2016 από υψηλού επιπέδου εξωτερικούς εμπειρογνώμονες, Καθηγητές Πανεπιστημίων της αλλοδαπής που επέλεξε η Αρχή της Διασφάλισης και Πιστοποίησης της Ποιότητας στην Ανώτατη Εκπαίδευση τρία στα δέκα ΑΕΙ πήραν άριστα, έξι στα 10 πολύ καλά, και ένα στα 10 πέρασε τη βάση.
Η διαδικασία αξιολόγησης στα δημόσια Πανεπιστήμια γίνεται κάθε 4 χρόνια και αποτελεί συνθήκη sine qua non για τη λειτουργία τους και την εξέλιξή τους.
Μια σημαντική επιτυχία του δημόσιου πολυνησιωτικού Πανεπιστημίου σε μία δύσκολη από πολλές απόψεις περίοδο. Συγχαρητήρια σε όλους τους ανθρώπους του Πανεπιστημίου Αιγαίου σε Λήμνο, Μυτιλήνη, Χίο, Σάμο, Σύρο και Ρόδο.